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新疆农科院园艺所成立于1979年，主要研究方向是新疆名特优瓜果蔬菜区划、栽培、育种、资源及产后技术开发利用。设甜西瓜、蔬菜、果树、加工贮藏研究室，拥有国家果树种植资源新疆名特果树圃和2个科技开发企业。全所职工70人，高级研究人员17人，其中吴明珠同志1999年当选为国家工程院院士，中级职称23人，博士、硕士研究生8名，国家级、省级优秀专家6名。"八五"全国科研开发综合实力百强研究所，某些学科在自治区级全国属领先水平。园艺所成立以来，先后承担国家省部级项目88项，其中获奖成果55项，国家和省部级二等奖以上18项，获国家发明专利一项。
甜西瓜育种研究是我所的强项，由中国工程院院士吴明珠研究员主持，在全国属领先水平。1997年自治区人民政府正式批准成立"新疆哈密瓜研究中心"，1999年正式组建"新疆哈密瓜种业有限责任公司"。"六五"－"九五"连续主持农业部专题、自治区重点攻关项目。先后培育出甜瓜新品种15个，西瓜新品种11个，通过几十年的南繁北育、远地域多亲复合杂交和抗病优质品种选育以及无土栽培研究，成功地将哈密瓜种植区域扩大到了全国，这是一个历史性突破。甜西瓜新品种的广泛应用，创造了数亿元的经济、社会效益。 我所发明?quot;葡萄促干剂"专利产品，1996年获国家发明四等奖，它是对新疆葡萄制干产业的历史性变革。葡萄促干剂的广泛应用，扩大了葡萄的种植面积，葡萄干质量也明显提高；将"促干剂"与葡萄新品种、制干新设施组装配套, 首次成功地将世界葡萄干区域推广到北纬44-45℃（乌鲁木齐）地区，增加了葡萄干的花色品种。与国际同类产品相比，使用操作简单、价格低廉、药效相同，深受广大果农的欢巡。 1992年以来农民使用此项技术累计获利达1．4亿元以上。 蔬菜育种。先后育成鲜食番茄新品种5个，加工番茄新品种3个，辣椒抗病新品种1个。针对近年来我区迅猛发展的加工番茄产业，我所子1994年育成了我区第一个加工番茄新番4号杂交晚熟新品种，又育成新番9号早熟新品种。杂交新品种的应用，对提高原料质量、增加产量、排开加工期起到了积极作用。 我所研制的香梨脱萼剂从根本上提高了香梨的品质，维护了新疆特色园艺的声誉。引进鲜食葡萄和酿酒葡萄新品种，为构建和实施万亩葡萄高技术示范园区，快速发展我区的葡萄产业，做了大量的积极有效的工作。引进的草莓、黑加仑、仁用杏优良品种，在北疆山区逆温带大面积生长。 承担自治区科技扶贫攻坚项目，依托我区优势资源对南疆杏、石油进行开发利用研究，为南疆人民脱贫致富，开辟了新途径。 我所为新疆农业结构调整，大力发展特色瓜果园艺做了大量的资源调查、区域规划设计工作，为新疆瓜果产业步入快速健康发展作出了贡献。
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